32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4067 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  61.07 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  59.48 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  50.5 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  51.4 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  51.4 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  51.6 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  48.39 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  48.72 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  48.03 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  30.66 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  39.06 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  38.28 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  35.29 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  38.81 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  34.09 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  37.4 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  38.97 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  36.29 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  26.89 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  35.25 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  31.33 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  33.61 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  39.16 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  32.45 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  36.08 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  28.64 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  37.98 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>