35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1292 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  471  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  57.63 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  54.89 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  52.12 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  47.9 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  59.4 
 
 		 243 aa  223  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  50.42 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  50.84 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  41.4 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  36.8 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  34.82 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  34.68 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  35.89 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  45.85 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  41.18 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  43.97 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  47.62 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  37.73 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  43.52 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  42.33 
 
 		 250 aa  104  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  35.54 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  40.5 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  42.07 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  41.58 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  35.42 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  35.2 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  35.94 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  36.14 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  32.64 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  32.92 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  37.43 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  35.88 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  37.4 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  36.29 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  34.26 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>