38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1437 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  93.52 
 
 
247 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  92.28 
 
 
247 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  72.47 
 
 
247 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  62.5 
 
 
248 aa  307  8e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  40.34 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  39.74 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  151  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  39.66 
 
 
244 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  37.61 
 
 
247 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  36.21 
 
 
255 aa  141  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  41.28 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  35.17 
 
 
238 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  38.1 
 
 
243 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  39.01 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  38.17 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  35.1 
 
 
237 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  41.45 
 
 
244 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  37.83 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  38.64 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  39.42 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  34.87 
 
 
277 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  34.07 
 
 
243 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  32.97 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  36.28 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  35.75 
 
 
247 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  33.89 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  32.8 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  30.08 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  40.18 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  38.81 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  36.15 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  33.64 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  33.64 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  35.05 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  33.64 
 
 
305 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  36.75 
 
 
287 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>