33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0179 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  59.48 
 
 		 302 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  60.5 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  54.51 
 
 		 312 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  53.98 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  47.74 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  51.99 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  50.55 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  48.19 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  48.55 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  28.72 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  36.51 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  36.51 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  37.68 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  38.41 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  33.82 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  35.71 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  31.8 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  27.53 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  27.88 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  29.77 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  34.13 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  34.48 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  35.77 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  37.31 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  31.34 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  34.17 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  33.07 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  31.82 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  37.5 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  38.93 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  36.51 
 
 		 245 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>