31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2426 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  544  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  60.98 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  56.76 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  48.72 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  49.64 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  48.38 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  52.49 
 
 		 287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  50.38 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  48.19 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  54.79 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  35.42 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  39.23 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  40.18 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  31.9 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  40.18 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  39.47 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  39.29 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  34.75 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  38.6 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  37.72 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  38.46 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  35.09 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  39.02 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  38.52 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  32.85 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  40.98 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  34.21 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  39.53 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  35.96 
 
 		 237 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  29.81 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>