28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1250 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  85.87 
 
 		 286 aa  341  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  48.39 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  52.43 
 
 		 313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  52 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  51.92 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  47.74 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  55.43 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  52.49 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  51.6 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  28.87 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  37.17 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  41.74 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  28.89 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  36.75 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  38.65 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  32 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  33.57 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  29.17 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  36.31 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  32.17 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  35.9 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  36.27 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  35.96 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  38.84 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>