35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0919 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  490  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  81.4 
 
 
249 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  80.58 
 
 
250 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  47.88 
 
 
243 aa  223  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  46.31 
 
 
247 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  51.03 
 
 
255 aa  208  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  51.67 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  43.85 
 
 
255 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  43.4 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  42.32 
 
 
243 aa  161  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  38.05 
 
 
247 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  36.23 
 
 
249 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  41.45 
 
 
247 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  41.45 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  41.45 
 
 
248 aa  135  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  37.24 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  40.93 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  40.93 
 
 
247 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  39.83 
 
 
246 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  36.23 
 
 
277 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  39.04 
 
 
307 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  44.44 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  37.31 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  37.17 
 
 
237 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  36.75 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  37.17 
 
 
236 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  38.19 
 
 
237 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  37.31 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  43.52 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  42.41 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  38.76 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  32.43 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  39.5 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  38.84 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  38.93 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>