33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1280 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  38.68 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  38.93 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  38.55 
 
 
255 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  41.49 
 
 
245 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  40.61 
 
 
237 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  38.5 
 
 
250 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  39 
 
 
247 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  34.85 
 
 
255 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  32.27 
 
 
247 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  36.23 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  36.23 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  35.54 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  31.75 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  38.17 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  36.93 
 
 
247 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  38.94 
 
 
247 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  36.51 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  35.54 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  35.75 
 
 
248 aa  115  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  33 
 
 
247 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  31.73 
 
 
237 aa  105  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  28.51 
 
 
307 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  32.88 
 
 
253 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  38.34 
 
 
237 aa  99  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  31.47 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  31.79 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  35.54 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  38.58 
 
 
281 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  35.76 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  26.89 
 
 
302 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  28.89 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>