32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1743 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  51.23 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  48.56 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  46.43 
 
 		 277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  42.52 
 
 		 307 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  41.18 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  40.62 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  38.57 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  36.44 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  32.27 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  38.05 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  32.93 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  36.56 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  38.27 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  37.34 
 
 		 247 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  39.75 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  29.02 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  29.46 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  32.97 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  32.97 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  30.81 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  33.15 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  30.43 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  32.5 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  27.55 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  34.08 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  35.2 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  33.14 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  40 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  36.59 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>