30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1666 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  66.33 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  60.98 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  51.4 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  47.3 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  54.24 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  47.64 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  50.55 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  51.6 
 
 		 287 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  52.63 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  30.83 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  37.6 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  34.55 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  38.05 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  34.85 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  37.17 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  37.17 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  36.28 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  38.06 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  42.61 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  31.01 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  38.41 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  35.62 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  41.67 
 
 		 244 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  33.74 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  37.5 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  40.14 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  42.36 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>