27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1986 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  85.66 
 
 
287 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  47.72 
 
 
302 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  51.02 
 
 
313 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  51.22 
 
 
312 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  52.36 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  54.79 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  48.91 
 
 
305 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  54.91 
 
 
318 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  52.59 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  31.67 
 
 
281 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  40.52 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  35.9 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  35.9 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  37.17 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  34.97 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  38.05 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  35.07 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  34.21 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  41.11 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  38.52 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  37 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  30.43 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  34.78 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  34.31 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  40.17 
 
 
249 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>