34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0655 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  627  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  87.54 
 
 		 312 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  50.5 
 
 		 302 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  52.5 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  53.98 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  52.43 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  49.64 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  51.45 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  47.64 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  50.88 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  29.62 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  34.11 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  34.97 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  32.14 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  36.59 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  36.89 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  30.25 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  36.59 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  38.21 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  35.77 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  34.43 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  37.12 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  40.15 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  37.4 
 
 		 247 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  36.67 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  28.12 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  37.04 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  36.19 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  34.43 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  38.17 
 
 		 238 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  30.34 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  38.24 
 
 		 244 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>