29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4212 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4212  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  613  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  64.72 
 
 		 305 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  51.6 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  52.84 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2426  hypothetical protein  56.76 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  51.09 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  51.45 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  55.43 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  50.69 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1986  hypothetical protein  53.82 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  34.08 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  34.1 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  38.58 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  33.93 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  35.48 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  38.35 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  35.97 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  36.3 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  34.65 
 
 		 248 aa  53.5  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  43.65 
 
 		 245 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  32.19 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  42.74 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  36.61 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  31.98 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  29.65 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  36.52 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  34.13 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  36.21 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>