36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2124 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  500  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  45.61 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  44.08 
 
 
255 aa  188  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  41.18 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  47.52 
 
 
255 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  46.15 
 
 
249 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  41.49 
 
 
249 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  45.38 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  43.4 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  45.91 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  41.13 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  39.91 
 
 
247 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  39.91 
 
 
247 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  38.57 
 
 
247 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  39.01 
 
 
247 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  38.94 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  38.6 
 
 
277 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  40.89 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  39.11 
 
 
307 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  40.84 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  39.92 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  39.79 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  39.73 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  36.07 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  40 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  33.06 
 
 
237 aa  109  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  36.07 
 
 
238 aa  98.6  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  42.93 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  40.27 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  39.16 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  32.64 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  36.31 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  35 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  39.06 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>