36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0136 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  54.89 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  50.64 
 
 
236 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  51.71 
 
 
238 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  55.79 
 
 
243 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  43.28 
 
 
237 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  43.22 
 
 
253 aa  188  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  44.3 
 
 
237 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  39.66 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  39.41 
 
 
247 aa  162  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  39.66 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  39.5 
 
 
247 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  39.32 
 
 
248 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  46 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  43.95 
 
 
249 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  35.43 
 
 
243 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  41.4 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  45.67 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  43.96 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  40.21 
 
 
255 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  46.04 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  33.14 
 
 
249 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  44.68 
 
 
243 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  34.08 
 
 
247 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  34.02 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  33.91 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  34.38 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  37.41 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  38.97 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  37.57 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  36.54 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  35.29 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  37.11 
 
 
305 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>