32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1439 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  516  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  47.13 
 
 
247 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  54.39 
 
 
247 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  46.28 
 
 
255 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  42.21 
 
 
243 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  46.69 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  43.85 
 
 
250 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  43.67 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  44.08 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  43.85 
 
 
244 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  38.22 
 
 
248 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  36.64 
 
 
247 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  38.22 
 
 
247 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  36.21 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  36.21 
 
 
247 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  34.85 
 
 
249 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  39.8 
 
 
277 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  37.1 
 
 
237 aa  139  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  36.56 
 
 
247 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  36.04 
 
 
253 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  39.48 
 
 
238 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  37.17 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  118  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  37 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  38.6 
 
 
237 aa  113  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  35.75 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  34.78 
 
 
307 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  40.21 
 
 
244 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  37.73 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  42.49 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  32.59 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  35.71 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>