35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0103 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  56.1 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  55.6 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  47.13 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  57.02 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  46.31 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  48.77 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  46.72 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  46.31 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  38.68 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  36.96 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  43.75 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  38.5 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  41.13 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  38.05 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  37.61 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  36.44 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  37.28 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  39.23 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  46 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  37.55 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  36.65 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  40.39 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  45.85 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  38.27 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  35.07 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  38.21 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  33.6 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  42.63 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  34.75 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  28.64 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  36.19 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0143  hypothetical protein  25.98 
 
 		 171 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  36.19 
 
 		 312 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>