46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3340 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3340  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 654 aa  76.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2884  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 453 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 1672 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1099 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 778 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  31.09 
 
 		 450 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4974  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.79 
 
 		 877 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2754  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0977  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0298  PAS  29.92 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17178  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 573 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3044  hypothetical protein  29.2 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703839 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4536  hypothetical protein  29.84 
 
 		 727 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.84 
 
 		 727 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 449 aa  54.7  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 1350 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2498  sensory box protein  29.92 
 
 		 775 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2263  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.92 
 
 		 727 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.659686  normal  0.0397719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2166  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.92 
 
 		 727 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2121  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.92 
 
 		 727 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.09 
 
 		 898 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0573  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.93 
 
 		 907 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1858  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.84 
 
 		 727 aa  51.2  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2140  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.21 
 
 		 693 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2160  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.91 
 
 		 727 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1920  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.23 
 
 		 727 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0874126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4866  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.91 
 
 		 896 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645914  normal  0.211732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0406  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  27.37 
 
 		 897 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2055  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.23 
 
 		 727 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614222  normal  0.877632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4770  PAS:GGDEF  22.96 
 
 		 897 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2545  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.03 
 
 		 454 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5754  hypothetical protein  24.29 
 
 		 899 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.26 
 
 		 729 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.447802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66320  hypothetical protein  23.57 
 
 		 899 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1821  putative diguanylate phosphodiesterase  27.27 
 
 		 725 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.398823  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2727  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.99 
 
 		 753 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.87 
 
 		 926 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 1319 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>