46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5973 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5973  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 324 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0249466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5748  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  89.81 
 
 		 324 aa  550  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0239802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2777  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  63.04 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0641341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1758  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  61.66 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1806  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  61.04 
 
 		 331 aa  352  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.965356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2142  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  61.04 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297347  normal  0.343222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1785  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  57.19 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2355  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  45.21 
 
 		 329 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0012  ABC transporter substrate-binding protein  46.44 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2671  hypothetical protein  46.8 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1928  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  43.54 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5955  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  44.59 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.764168  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3935  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  42.02 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1864  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  39.33 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.114682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2852  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  45.79 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.26 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4594  putative ABC transporter periplasmic solute- binding protein  29.92 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.751076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  27.64 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  26.64 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  25.64 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1296  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  30.87 
 
 		 474 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232575  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.53 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4066  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  35.09 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4880  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  37.5 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.779449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  32.28 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1595  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.53 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.18 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1367  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic solute-binding protein  26.57 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1528  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  33.66 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5870  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.32 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.626499  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3719  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.93 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.0719677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3410  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.37 
 
 		 320 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.47 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2884  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  34.86 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1682  hypothetical protein  23.81 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30510  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  27.67 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.846388  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3932  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  36.45 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0335865  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4326  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.04 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5871  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.45 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4434  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.45 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3294  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.31 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19540  hypothetical protein  23.44 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5823  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.71 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  hitchhiker  0.00768111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3161  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  27.63 
 
 		 467 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.230597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.8 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 354 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>