39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2777 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2777  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 326 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0641341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2142  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  65.89 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297347  normal  0.343222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1758  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  63.89 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1806  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  64.2 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.965356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5748  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  62.27 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0239802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5973  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  63.04 
 
 		 324 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0249466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1785  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  51.8 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2355  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  45.15 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2671  hypothetical protein  45.85 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5955  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  44.05 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.764168  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0012  ABC transporter substrate-binding protein  41.3 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3935  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  42.09 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1928  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  38.29 
 
 		 332 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1864  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  36.77 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.114682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2852  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  41.25 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.97 
 
 		 367 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4594  putative ABC transporter periplasmic solute- binding protein  30.12 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.751076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  28.04 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  23.14 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3606  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.08 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31360  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  25.41 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  26.57 
 
 		 323 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.45 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2884  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  34.95 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3398  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  29.41 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.860812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30510  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  25.09 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.846388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  28.79 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0929  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.1 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520778  normal  0.417573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1296  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  26.14 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232575  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4880  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1170  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0662412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.57 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  28.18 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.6 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>