42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2852 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2852  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  100 
 
 		 329 aa  634    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1928  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  46.73 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1864  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  42.09 
 
 		 346 aa  268  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.114682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2671  hypothetical protein  45.19 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2355  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  48.68 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3935  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  43.96 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1785  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  45.85 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5973  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  46.8 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0249466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5748  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  45.57 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0239802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2777  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  41.25 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0641341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5955  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  37.89 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.764168  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0012  ABC transporter substrate-binding protein  38.63 
 
 		 351 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1758  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  37.95 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2142  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  37.46 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297347  normal  0.343222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1806  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  37.46 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.965356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.71 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4594  putative ABC transporter periplasmic solute- binding protein  29.43 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.751076  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.88 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  28.69 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.39 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21410  ABC transporter, substrate binding protein, family 3  29.68 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.12 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.08 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  27.18 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.88 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5767  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  22.57 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  29.66 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  27.5 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  29.66 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  29.32 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  27.88 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5515  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.92 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0568  hypothetical protein  30.43 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  25.12 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  23.42 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2763  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like protein  27.54 
 
 		 309 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.501553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  30.61 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>