29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2671 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2671  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3935  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  65.37 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2355  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  61 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1928  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  43.22 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5973  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  46.8 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0249466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5748  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  45.64 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0239802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2852  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  45.18 
 
 		 329 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1864  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein  41.29 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.114682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1785  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  43.43 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2777  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  45.45 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0641341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5955  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.16 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.764168  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1758  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  40.86 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0012  ABC transporter substrate-binding protein  38.85 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1806  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  40.68 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.965356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2142  putative ABC transporter periplasmic solute-binding protein  40.68 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297347  normal  0.343222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.64 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4594  putative ABC transporter periplasmic solute- binding protein  30.07 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.751076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.12 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.22 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  25 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  28.65 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  28.65 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.34 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  36.05 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3031  ABC aliphatic sulfonates transporter, periplasmic ligand binding protein  36.67 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  25.24 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30510  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  24.23 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.846388  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  36.05 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>