53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1072 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  92.71 
 
 		 192 aa  357  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  58.69 
 
 		 213 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  61.78 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  60.32 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  53.81 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  55.4 
 
 		 213 aa  224  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  59.18 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  57.59 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  58.16 
 
 		 196 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  51.04 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  51.56 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  49.21 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  45.31 
 
 		 193 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  48.95 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  45.83 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  45.83 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  46.84 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  47.64 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  42.93 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  43.75 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  45.26 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  41.45 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  41.45 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  36.87 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  42.7 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  41.9 
 
 		 221 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  40.32 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  38.76 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  38.46 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  36.72 
 
 		 181 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  39.78 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  36.81 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  36.81 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  39.47 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  37.57 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  36.81 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  36.67 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  37.99 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  37.63 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  37.63 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  37.22 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  36.67 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  43.88 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  35.56 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  35.91 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  36.67 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  36.16 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  37.08 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>