53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4214 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  377  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  88.14 
 
 
194 aa  336  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  82.99 
 
 
194 aa  317  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  71.65 
 
 
194 aa  288  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  72.16 
 
 
194 aa  285  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  68.04 
 
 
194 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  67.53 
 
 
194 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  67.01 
 
 
194 aa  261  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  47.42 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  48.86 
 
 
182 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  50.57 
 
 
184 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  47.64 
 
 
192 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  48.69 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  47.12 
 
 
194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  45.26 
 
 
194 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  45.55 
 
 
192 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  42.05 
 
 
201 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  42.05 
 
 
201 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  46.32 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  43.16 
 
 
192 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  40.51 
 
 
196 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  40.51 
 
 
196 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  40.31 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  41.49 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  41.49 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  41.49 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  44.44 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  39.79 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  39.81 
 
 
213 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  40.21 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  40.21 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  40.78 
 
 
181 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  40.91 
 
 
181 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  42.86 
 
 
196 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  39.36 
 
 
196 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  37.23 
 
 
196 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  41.18 
 
 
199 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  35.59 
 
 
223 aa  121  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  42.17 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  43.01 
 
 
183 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  39.36 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  36.97 
 
 
213 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  39.25 
 
 
221 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  38.46 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  38.27 
 
 
196 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  40.66 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  40.66 
 
 
201 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  37.04 
 
 
197 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  39.89 
 
 
200 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  40.43 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  39.89 
 
 
200 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  39.36 
 
 
200 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  36.17 
 
 
200 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>