53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0152 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  100 
 
 
181 aa  358  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  85.64 
 
 
181 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  63.48 
 
 
181 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  49.69 
 
 
181 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  38.73 
 
 
182 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  41.34 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  37.99 
 
 
194 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  41.01 
 
 
184 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  39.77 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  39.11 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  37.43 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  41.34 
 
 
194 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  37.22 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  37.22 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  35.75 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  38.71 
 
 
183 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  39.66 
 
 
192 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  39.23 
 
 
192 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  36.13 
 
 
194 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  35.33 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  33.71 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  32.6 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  36.75 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  33.7 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  38.21 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  32.66 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  31.49 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  32.61 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  30.39 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  33.15 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  35.14 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  30.39 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  32.79 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  32.07 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  31.1 
 
 
223 aa  72  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  34.43 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  31.82 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  34.45 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  30.86 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  36.59 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  34.59 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  30.43 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  35.51 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  29.35 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  29.35 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  29.35 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  30.48 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  29.35 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  29.35 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  28.39 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>