53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2427 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  82.47 
 
 		 194 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  82.99 
 
 		 194 aa  300  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  69.59 
 
 		 194 aa  277  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  69.07 
 
 		 194 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  68.04 
 
 		 194 aa  261  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  64.43 
 
 		 194 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  63.92 
 
 		 194 aa  248  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  48.45 
 
 		 194 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  49.43 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  53.71 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  51.05 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  48.95 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  47.12 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  47.37 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  45.79 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  45.74 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  44.74 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  41.36 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  41.36 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  44.57 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  44.26 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  41.24 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  44.26 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  44.26 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  42.11 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  41.3 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  42.93 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  40.28 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  43.24 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  37.1 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  37.91 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  42.39 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  41.14 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  43.78 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  39.66 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  40.98 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  41.34 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  37.7 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  40.12 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  36.46 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  39.34 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  40.88 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  41.76 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  38.04 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  39.89 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  39.34 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  39.89 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  38.8 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  37.57 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>