53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2287 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  69.47 
 
 
201 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  67.86 
 
 
196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  60.62 
 
 
200 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  54.92 
 
 
195 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  55.61 
 
 
196 aa  224  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  55.84 
 
 
198 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  55.84 
 
 
198 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  55.84 
 
 
198 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  55.15 
 
 
196 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  53.61 
 
 
196 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  53.09 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  53.37 
 
 
200 aa  208  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  58.29 
 
 
197 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  52.33 
 
 
200 aa  201  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  51.04 
 
 
200 aa  197  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  50 
 
 
199 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  50.78 
 
 
200 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  51.3 
 
 
200 aa  191  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  49.47 
 
 
199 aa  187  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  45.6 
 
 
221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  44.32 
 
 
183 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  42.39 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  40.66 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  40.44 
 
 
194 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  41.76 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  40.78 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  38.25 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  36.17 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  39.34 
 
 
194 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  39.47 
 
 
192 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  36.72 
 
 
193 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  36.61 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  36.96 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  41.04 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  36.96 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  36.96 
 
 
192 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  32.96 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  34.65 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  32.96 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  37.64 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  34.64 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  34.46 
 
 
193 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  35.52 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  31.75 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  33.17 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  31.75 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  30.48 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  30.81 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  36.7 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  35.94 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>