53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4066 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  83.1 
 
 		 213 aa  354  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  71.3 
 
 		 223 aa  318  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  69.95 
 
 		 196 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  69.48 
 
 		 196 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  60.38 
 
 		 194 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  58.69 
 
 		 192 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  58.49 
 
 		 194 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  56.81 
 
 		 192 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  54.76 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  46.48 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  45.54 
 
 		 193 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  41.78 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  37.79 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  40.76 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  40.28 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  39.81 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  38.03 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  38.03 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  38.43 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  39.53 
 
 		 194 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  39.81 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  37.26 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  37.26 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  34.5 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  40.1 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  35.21 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  34.15 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  34.15 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  34.15 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  32.67 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  33 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  32.67 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  32.02 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  33.66 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  34.33 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  34 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  34.65 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  32.66 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  33.98 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  32.5 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  33.67 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  31.5 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  32.84 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  32.34 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  30.69 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  33.17 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  32.34 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  31.03 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  31.34 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  30.3 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  32.39 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  31.34 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>