53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6119 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  74.49 
 
 
200 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  72.45 
 
 
200 aa  303  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  71.94 
 
 
200 aa  298  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  71.43 
 
 
200 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  64.8 
 
 
199 aa  270  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  65.5 
 
 
199 aa  265  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  66.13 
 
 
195 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  57.53 
 
 
196 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  55.73 
 
 
198 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  55.73 
 
 
198 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  55.73 
 
 
198 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  56.45 
 
 
196 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  55.91 
 
 
196 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  54.3 
 
 
196 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  54.1 
 
 
197 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  52.11 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  51.04 
 
 
196 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  51.61 
 
 
200 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  43.41 
 
 
221 aa  157  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  42.05 
 
 
183 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  38.04 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  39.11 
 
 
194 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  36.9 
 
 
194 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  39.56 
 
 
193 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  37.57 
 
 
194 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  38.38 
 
 
194 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  37.63 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  34.44 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  34.44 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  38.8 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  35.68 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  36.52 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  37.17 
 
 
192 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  35.87 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  35.2 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  36.52 
 
 
181 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  34.83 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  32.4 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  34.44 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  31.16 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  31.16 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  33.89 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  32.61 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  30.94 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  32.24 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  33.17 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  31.16 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  35.51 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  33.12 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>