53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5583 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  100 
 
 
200 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  95 
 
 
200 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  88.5 
 
 
200 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  87 
 
 
200 aa  362  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  71.43 
 
 
200 aa  298  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  71 
 
 
199 aa  291  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  69.74 
 
 
195 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  62.5 
 
 
199 aa  263  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  58.67 
 
 
196 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  58.16 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  59.18 
 
 
198 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  59.18 
 
 
198 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  59.18 
 
 
198 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  58.67 
 
 
196 aa  231  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  55.1 
 
 
196 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  54.01 
 
 
197 aa  205  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  52.11 
 
 
196 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  51.3 
 
 
196 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  49.23 
 
 
200 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  43.96 
 
 
221 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  46.07 
 
 
183 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  40.33 
 
 
182 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  42.08 
 
 
194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  39.89 
 
 
194 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  40.56 
 
 
184 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  38.12 
 
 
193 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  39.67 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  39.67 
 
 
194 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  38.5 
 
 
194 aa  101  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  37.77 
 
 
194 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  38.92 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  38.59 
 
 
194 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  36.81 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  36.81 
 
 
201 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  37.7 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  36.67 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  35.75 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  35.52 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  36.61 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  36.56 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  35 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  37.22 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  35.56 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  32.42 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  30.43 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  30.43 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  35.77 
 
 
181 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  31.43 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  31.34 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  30.85 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>