53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4259 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  64.61 
 
 
181 aa  227  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  64.24 
 
 
181 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  39.31 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  40.22 
 
 
194 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  44.3 
 
 
181 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  43.02 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  44.44 
 
 
194 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  41.24 
 
 
184 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  39.11 
 
 
194 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  40.22 
 
 
194 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  40.22 
 
 
194 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  41.34 
 
 
194 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  39.66 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  36.31 
 
 
194 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  36.16 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  35.59 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  35.71 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  35.71 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  37.31 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  34.43 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  35.94 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  32.04 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  35.92 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  33.7 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  30.94 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  30.3 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  36.19 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  36 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  40.38 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  30.56 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  37.1 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  32.24 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  33.12 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  32.8 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  32.8 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  32.8 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  32.92 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  37.5 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  37.5 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  34.31 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  32.97 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  30.57 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  29.81 
 
 
223 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  30.43 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  34.21 
 
 
221 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  37.86 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  30.05 
 
 
200 aa  61.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  28.79 
 
 
213 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  29.19 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  29.51 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  28.26 
 
 
196 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  32.56 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>