53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2675 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  95.41 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  90.31 
 
 		 196 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  90.77 
 
 		 198 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  90.77 
 
 		 198 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  90.77 
 
 		 198 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  87.24 
 
 		 196 aa  361  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  58.46 
 
 		 195 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  63.64 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  61.05 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  58.42 
 
 		 200 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  58.16 
 
 		 200 aa  234  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  56.63 
 
 		 200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  60 
 
 		 199 aa  231  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  56.12 
 
 		 200 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  53.12 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  52.06 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  56.45 
 
 		 200 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  53.09 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  51.53 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  46.15 
 
 		 221 aa  176  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  44.38 
 
 		 183 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  41.3 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  39.13 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  42.08 
 
 		 194 aa  127  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  39.89 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  41.21 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  39.67 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  38.5 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  39.34 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  37.77 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  37.77 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  36.22 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  37.43 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  37.36 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  37.23 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  37.36 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  36.81 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  35.71 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  35.71 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  33.51 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  34.03 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  35 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  32.02 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  29.72 
 
 		 223 aa  91.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  36.84 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  30.81 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  27.59 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  30.77 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  28.26 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>