53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2129 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  74.09 
 
 
193 aa  298  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  59.07 
 
 
192 aa  248  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  50.52 
 
 
194 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  50.52 
 
 
194 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  52.58 
 
 
194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  51.56 
 
 
192 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  45.54 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  45.41 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  44.9 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  43.05 
 
 
223 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  41.78 
 
 
213 aa  150  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  41.36 
 
 
194 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  42.11 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  37.5 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  38.02 
 
 
194 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  39.79 
 
 
194 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  39.27 
 
 
194 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  38.22 
 
 
194 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  37.17 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  36.22 
 
 
196 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  36.73 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  39.78 
 
 
198 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  39.78 
 
 
198 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  39.78 
 
 
198 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  34.25 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  36.73 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  37.22 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  39.34 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  35.71 
 
 
196 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  37.99 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  39.23 
 
 
195 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  38.1 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  39.56 
 
 
200 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  37.63 
 
 
199 aa  104  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  38.12 
 
 
200 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  37.57 
 
 
200 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  35.03 
 
 
181 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  38.12 
 
 
200 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  36.87 
 
 
200 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  37.22 
 
 
221 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  36.72 
 
 
196 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  36.22 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  35.75 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  38.59 
 
 
196 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  35.87 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  36.16 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  38.1 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  36.28 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  34.31 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>