53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4326 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4326  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.0725647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2521  hypothetical protein  76.96 
 
 
196 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2287  hypothetical protein  69.47 
 
 
196 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0119695 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5502  protein of unknown function DUF1185  66.49 
 
 
200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3231  hypothetical protein  55.73 
 
 
196 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675483  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3437  hypothetical protein  55.21 
 
 
196 aa  235  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2264  hypothetical protein  56.85 
 
 
198 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2086  hypothetical protein  56.85 
 
 
198 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234769  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2259  hypothetical protein  56.85 
 
 
198 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128222  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2217  peptide synthase  56.25 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0532152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2409  hypothetical protein  55.21 
 
 
196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.408733  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2675  hypothetical protein  53.12 
 
 
196 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6255  hypothetical protein  53.72 
 
 
200 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2480  hypothetical protein  51.6 
 
 
199 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6119  hypothetical protein  50 
 
 
200 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205354  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6083  hypothetical protein  52.13 
 
 
200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4153  hypothetical protein  51.34 
 
 
199 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5583  protein of unknown function DUF1185  50 
 
 
200 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6550  protein of unknown function DUF1185  48.94 
 
 
200 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0260848  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1966  hypothetical protein  53.23 
 
 
197 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0987839  normal  0.289885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0082  protein of unknown function DUF1185  50.27 
 
 
221 aa  187  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0083  protein of unknown function DUF1185  44.07 
 
 
183 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2427  hypothetical protein  40.88 
 
 
194 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2145  protein of unknown function DUF1185  35.71 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1664  hypothetical protein  38.33 
 
 
194 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1072  protein of unknown function DUF1185  39.78 
 
 
192 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6724  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6489  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2527  protein of unknown function DUF1185  37.84 
 
 
182 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0181  protein of unknown function DUF1185  37.78 
 
 
194 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0369  hypothetical protein  42.78 
 
 
184 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.555873  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4214  hypothetical protein  40.66 
 
 
194 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2104  hypothetical protein  38.12 
 
 
192 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  decreased coverage  0.00974706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4065  hypothetical protein  37.78 
 
 
194 aa  101  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00340638  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0856  hypothetical protein  37.22 
 
 
194 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4213  hypothetical protein  37.16 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1060  protein of unknown function DUF1185  37.06 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3814  hypothetical protein  37.78 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249604  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2129  hypothetical protein  35.75 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.613913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4326  protein of unknown function DUF1185  37.02 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136074  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0657  hypothetical protein  37.02 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452265  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4066  hypothetical protein  33.66 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00119297  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3662  hypothetical protein  35.75 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353198  normal  0.0552159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4325  protein of unknown function DUF1185  32.97 
 
 
196 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.532972  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0656  hypothetical protein  32.97 
 
 
196 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5715  protein of unknown function DUF1185  35.75 
 
 
192 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1665  hypothetical protein  34.41 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1430  hypothetical protein  35.29 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0855  hypothetical protein  30.66 
 
 
223 aa  85.5  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0437  hypothetical protein  32.6 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480916  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0180  protein of unknown function DUF1185  30.2 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0152  protein of unknown function DUF1185  38.21 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4259  hypothetical protein  32.97 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090692  hitchhiker  0.000156871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>