More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3368 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  49.81 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  47.97 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  50.41 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  49.8 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  45.88 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  54.88 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  45.05 
 
 		 375 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  50 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  47.31 
 
 		 269 aa  247  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  50.4 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  49.82 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  50.41 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  47.86 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  49.78 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  46.96 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  47.88 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  49.38 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  49.4 
 
 		 263 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  47.74 
 
 		 288 aa  242  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  48.95 
 
 		 369 aa  241  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  49.79 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  48.54 
 
 		 365 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  47.97 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  49.38 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  46.84 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  49.17 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  51.43 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  48.95 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  50.21 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  48.95 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  49.15 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  47.16 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  46.22 
 
 		 329 aa  238  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  48.77 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  44.79 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  48.71 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  51.43 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  51.77 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  48.13 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  51.05 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  50.95 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  44.06 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  48.16 
 
 		 309 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  45.93 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  45.62 
 
 		 304 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  43.31 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  45.26 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  45.69 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  44.44 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  47.22 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  47.13 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  47.13 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  45.2 
 
 		 357 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  47.13 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  47.7 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  47.15 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  46.34 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  45.45 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  48.03 
 
 		 405 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  46.78 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  44.85 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  46.27 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  45.66 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  47.9 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  48.89 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  48.13 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  46.36 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  49.57 
 
 		 289 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  48.13 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  48.13 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  46.83 
 
 		 513 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  47.74 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  47.06 
 
 		 383 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  44.8 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  49.1 
 
 		 393 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  46.89 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  47.06 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  45.98 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  44.57 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  46.83 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  46.83 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  46.83 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  48.28 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  46.83 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  47.98 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  47.79 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  45.83 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  49.31 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  48 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  46.98 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  45.77 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  45.15 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  45.83 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  48.5 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  46.7 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  47.77 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  48.18 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  43.73 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>