More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1564 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1564  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1874  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.174195  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  32.97 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  33.01 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  33.01 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 242 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 289 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  30.86 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 186 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  27.66 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 342 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  35.82 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 292 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  31.71 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  36.99 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  38.24 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  26.9 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  29.49 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  24.27 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  26.92 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  24.6 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  29.07 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  24.66 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  34.33 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  30 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  25.64 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  36.92 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  23.18 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  37.14 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 342 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>