More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1406 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  78.35 
 
 		 426 aa  693    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  95.22 
 
 		 418 aa  815    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 418 aa  850    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  94.5 
 
 		 418 aa  810    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  72.26 
 
 		 419 aa  617  1e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  48.19 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.41 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.74 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  46.6 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.99 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.34 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  44.5 
 
 		 424 aa  348  7e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.66 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.09 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.65 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  42.19 
 
 		 427 aa  328  9e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.03 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.11 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.22 
 
 		 423 aa  319  5e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.97 
 
 		 382 aa  319  7e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.47 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  44.84 
 
 		 444 aa  310  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.82 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.38 
 
 		 417 aa  302  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.15 
 
 		 411 aa  295  7e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.48 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.06 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.61 
 
 		 418 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  32.35 
 
 		 349 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  34.68 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  34.39 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  34.68 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  34.39 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  34.68 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  31.59 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  34.1 
 
 		 334 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  34.91 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  34.91 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  32.46 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  31.44 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  32.48 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  32.29 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  33.04 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  32.95 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  33.33 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  30.86 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  31.14 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  30.19 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  30.65 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  29.89 
 
 		 359 aa  137  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  31.7 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  31.7 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  31.33 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  30.72 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  31.27 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  30.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  30.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  30.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  31.61 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  30.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  30.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  30.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  30.8 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  30.8 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  30.8 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  31.25 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  30.36 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  28.86 
 
 		 339 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  31.33 
 
 		 328 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  29.41 
 
 		 352 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  30.06 
 
 		 337 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2312  cytoplasmic asparaginase I  29.6 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000448344  hitchhiker  0.000363201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  29.31 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  30.9 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  29.23 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  30.9 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  30.9 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  30.9 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1680  cytoplasmic asparaginase I  29.86 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  30.64 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  29.89 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  31.32 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5627  asparaginase  28.01 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0567778  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  28.92 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  31.61 
 
 		 337 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  33.1 
 
 		 337 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  29.41 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  30.31 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  30.31 
 
 		 337 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  30.31 
 
 		 337 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  33.1 
 
 		 337 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  33.1 
 
 		 337 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  33.13 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  30.31 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  31.79 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  31.1 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  29.21 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  29.21 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  29.21 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  34.78 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>