More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1002 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 410 aa  842    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  63.26 
 
 		 415 aa  557  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  60.87 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  56.33 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  57.91 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  55.33 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  56.43 
 
 		 383 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  53.16 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  53.21 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  53.33 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  52.36 
 
 		 427 aa  421  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.37 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  51.16 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.41 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  45.93 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  50.12 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  46.17 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.93 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.76 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  48.44 
 
 		 439 aa  352  5e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  45.48 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.81 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.39 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.56 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.33 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.41 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.69 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.22 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  33.91 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  34.97 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  34.59 
 
 		 334 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  35.01 
 
 		 329 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  34.49 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  34.49 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  34.49 
 
 		 334 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  34.11 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  34.78 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  34.49 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  33.62 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  33.62 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  34.12 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  32.25 
 
 		 325 aa  156  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  33.33 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  30.64 
 
 		 342 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  31.07 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  32.04 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  32.28 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  31.05 
 
 		 359 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  31.36 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  31.01 
 
 		 336 aa  146  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  31.01 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  31.18 
 
 		 342 aa  144  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  30.68 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  31.23 
 
 		 339 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  32.74 
 
 		 344 aa  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  32.63 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  32.25 
 
 		 335 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  32.02 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  30.09 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  28.38 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  30.35 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  32.3 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  29.78 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  30.38 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  32.13 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3330  L-asparaginase, type I  29.15 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  32.13 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  33.03 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  34.83 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  28.32 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  28.65 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  28.82 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  28.89 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  32.42 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  31.93 
 
 		 348 aa  126  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  30.33 
 
 		 324 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  30.33 
 
 		 324 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  28.05 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  30.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  30.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  30.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  30.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  30.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  30.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  30.39 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  29 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  28.49 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  30.39 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  30.31 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2298  cytoplasmic asparaginase I  30.45 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000114011  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  29.28 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  29.62 
 
 		 348 aa  123  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27196  predicted protein  30.26 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664269  normal  0.0275025 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29713  predicted protein  30.26 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.841946  hitchhiker  0.00675888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  30.07 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  30.24 
 
 		 324 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  29.41 
 
 		 338 aa  123  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1807  asparaginase  28.03 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0241049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  27.73 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  27.5 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>