More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0083 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 
410 aa  843    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  63.7 
 
 
409 aa  535  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  65.44 
 
 
382 aa  509  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  63.68 
 
 
383 aa  510  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  59.2 
 
 
411 aa  481  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  56.33 
 
 
410 aa  455  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  54.66 
 
 
415 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  53.46 
 
 
424 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  51.9 
 
 
424 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  54.81 
 
 
413 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  51.3 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.81 
 
 
423 aa  396  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  48.39 
 
 
434 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  44.53 
 
 
411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.55 
 
 
418 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.65 
 
 
418 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.68 
 
 
418 aa  325  7e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.44 
 
 
419 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.06 
 
 
426 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.93 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.75 
 
 
439 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.744807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  39.38 
 
 
444 aa  291  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.37 
 
 
417 aa  275  7e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.53 
 
 
417 aa  265  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.46 
 
 
417 aa  262  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.9 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.93 
 
 
447 aa  247  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  30.77 
 
 
339 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  30.09 
 
 
335 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  30.03 
 
 
334 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  31.37 
 
 
325 aa  143  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  29.45 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  29.74 
 
 
334 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  33.04 
 
 
338 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  29.45 
 
 
334 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  30.03 
 
 
334 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  29.45 
 
 
334 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  30.97 
 
 
329 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  28.86 
 
 
334 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  28.86 
 
 
334 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  29.46 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  31.01 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  31.16 
 
 
342 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  30.51 
 
 
342 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  29.71 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  29.06 
 
 
347 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  29.02 
 
 
342 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  33.22 
 
 
339 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  29.18 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  29.91 
 
 
340 aa  120  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  28.21 
 
 
349 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  28.99 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  29.34 
 
 
342 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  32.93 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2298  cytoplasmic asparaginase I  30.74 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000114011  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  32.78 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  28 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  28 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  32.05 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 
337 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 
337 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  28.26 
 
 
327 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  28.26 
 
 
327 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  31.56 
 
 
339 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  28.53 
 
 
359 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2421  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  30.58 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  29.13 
 
 
339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  27.71 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  30.09 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  28.57 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  30.34 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  28.12 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  32.73 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  27.67 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  28.98 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  29.07 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  27.95 
 
 
335 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  28.61 
 
 
336 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  31.19 
 
 
330 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  28.61 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  31.09 
 
 
334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  29.06 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  30.82 
 
 
338 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  30.56 
 
 
338 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  30.82 
 
 
338 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  31.54 
 
 
338 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  31.21 
 
 
338 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  27.89 
 
 
327 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  32.73 
 
 
348 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  28.16 
 
 
337 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  31.21 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  31.21 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  31.37 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  31.21 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  31.21 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  31.21 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>