More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0144 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  77.83 
 
 		 417 aa  650    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  79.33 
 
 		 417 aa  679    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 417 aa  834    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  76.79 
 
 		 418 aa  611  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.84 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  50.83 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  44.58 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.35 
 
 		 418 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  45.61 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.83 
 
 		 418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.87 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.59 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.15 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  42.18 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.75 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.76 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  37.68 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.17 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  42.18 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.1 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  41.84 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.57 
 
 		 424 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.36 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.57 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.71 
 
 		 382 aa  260  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.64 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.93 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.68 
 
 		 411 aa  245  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  33.05 
 
 		 341 aa  157  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  33.14 
 
 		 339 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  32.43 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  32.28 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  31.41 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  31.7 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  31.41 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  31.41 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  31.41 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  31.41 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  31.41 
 
 		 334 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1807  asparaginase  29.59 
 
 		 329 aa  126  8.000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0241049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  32.72 
 
 		 337 aa  126  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  30.94 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  30.94 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  31.87 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  29.39 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  28.53 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  32.88 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  29.6 
 
 		 337 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  28.82 
 
 		 339 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  29.6 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  28.86 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  31.44 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  30.51 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  29.51 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  29.51 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  29.51 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  28.07 
 
 		 337 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2421  cytoplasmic asparaginase I  29.17 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  31.16 
 
 		 359 aa  113  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2037  asparaginase  32.67 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  29.27 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  29.7 
 
 		 337 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  28.79 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  28.67 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  28.99 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 		 338 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  29.58 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  28.32 
 
 		 342 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2312  cytoplasmic asparaginase I  29.02 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000448344  hitchhiker  0.000363201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  30.3 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  30.3 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  30.3 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  32.33 
 
 		 340 aa  109  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  30.3 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  27.84 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  28.28 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  28.04 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  29.54 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  29.54 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  29.54 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  29.54 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  30.3 
 
 		 338 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2298  cytoplasmic asparaginase I  29.17 
 
 		 337 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000114011  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  31.87 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  30.43 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  29.79 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00170  asparaginase, putative  30.38 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000410367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  27.46 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1680  cytoplasmic asparaginase I  30.22 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  28.77 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>