More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0853 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 409 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  68.95 
 
 		 382 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  63.7 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  66.84 
 
 		 383 aa  511  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  61.92 
 
 		 411 aa  487  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.39 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  55.33 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  54.05 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  54.85 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  53.44 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  52.22 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.84 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  49.88 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.87 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.03 
 
 		 418 aa  328  9e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.79 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.79 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  45.81 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  45.94 
 
 		 451 aa  323  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.76 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  43.51 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.37 
 
 		 439 aa  287  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.95 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.62 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.81 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.88 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.47 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.1 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  32.74 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  32.94 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  32.54 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  34.38 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  31.1 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  30.46 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  31.25 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  29.6 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  30.46 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  30.46 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  32.13 
 
 		 348 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  30.46 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  30.88 
 
 		 342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  30.46 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  30.84 
 
 		 335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  32 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  29.6 
 
 		 334 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  29.6 
 
 		 334 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  31.3 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  30.97 
 
 		 348 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  29.89 
 
 		 334 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  27.62 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  33.81 
 
 		 330 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  27.54 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  27.22 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  32.36 
 
 		 335 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  27.22 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  28.91 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  29.18 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  30.42 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  32.68 
 
 		 338 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  28.79 
 
 		 340 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  33.44 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  32.65 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  29.62 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  29.62 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  28.16 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  29.63 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  29.57 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  28.22 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  32.64 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  32.64 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  31.89 
 
 		 355 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  31.69 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  28.82 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  31.56 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  28.99 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  29.34 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  31.68 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  28 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  32.64 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  28.35 
 
 		 324 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  29.85 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  31.72 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2298  cytoplasmic asparaginase I  29.65 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000114011  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  31.6 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  31.6 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  31.6 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  32.29 
 
 		 338 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  31.05 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  31.05 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  29.08 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  29.91 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  29.91 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  29.07 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>