More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1079 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 383 aa  784    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  68.67 
 
 		 382 aa  536  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  66.84 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  63.68 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  61.29 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  56.43 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  56.61 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  53.08 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  53.54 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.48 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  51.13 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.82 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  49.38 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  47.88 
 
 		 411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.48 
 
 		 419 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.47 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.62 
 
 		 418 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.47 
 
 		 418 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.97 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.99 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.82 
 
 		 439 aa  289  7e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.21 
 
 		 429 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  41.39 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.79 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.05 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.64 
 
 		 418 aa  243  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.93 
 
 		 417 aa  242  7e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.3 
 
 		 447 aa  221  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  32.95 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  30.88 
 
 		 335 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  30.86 
 
 		 347 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  31.29 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  28.06 
 
 		 349 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  31.6 
 
 		 330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  32.45 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  29.48 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  30.32 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  30.79 
 
 		 342 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  30.03 
 
 		 335 aa  126  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  27.05 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  33.33 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  26.61 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  31.76 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  31.76 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  28.66 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  28.2 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  28.4 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  29.46 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  29.46 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  28.57 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  28.4 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  28.96 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  28.87 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  28.87 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  30.29 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  30.57 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  28.41 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  28.4 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  31.33 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  29.97 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  31.77 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  31.29 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  28.74 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  29.33 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1680  cytoplasmic asparaginase I  30.41 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  29.33 
 
 		 336 aa  116  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  32.43 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  28.99 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  30.15 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  28.96 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  28.44 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  29.55 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3330  L-asparaginase, type I  31.25 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519795  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  28.65 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  28.06 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  31.99 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  31.99 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  31.99 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  29.74 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  31.72 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  28.82 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  30.74 
 
 		 338 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  30.48 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  30.59 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  29.76 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  30.59 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  30.29 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  30.29 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  30.41 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  30.41 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  30.41 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  30.41 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  30.29 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>