More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2140 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 
434 aa  868    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  73.53 
 
 
424 aa  628  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  71.75 
 
 
427 aa  610  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  68.13 
 
 
413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  68.82 
 
 
423 aa  558  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  50.46 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  51.16 
 
 
410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  47.83 
 
 
424 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.23 
 
 
382 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  50.61 
 
 
411 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  50.12 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  49.08 
 
 
410 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  49.88 
 
 
383 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.03 
 
 
418 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.34 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.34 
 
 
418 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  43.88 
 
 
411 aa  316  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.11 
 
 
419 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.16 
 
 
426 aa  306  7e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.86 
 
 
451 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.83 
 
 
439 aa  281  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  37.76 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.96 
 
 
417 aa  267  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  39.05 
 
 
444 aa  264  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.24 
 
 
417 aa  258  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.18 
 
 
417 aa  250  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.95 
 
 
418 aa  244  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.09 
 
 
447 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  29.97 
 
 
339 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  33.15 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  30.96 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  31.02 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  31.58 
 
 
334 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  28.77 
 
 
357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  30.43 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  31.02 
 
 
334 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  31.3 
 
 
348 aa  126  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  31.05 
 
 
335 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  31.06 
 
 
339 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  31.02 
 
 
334 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  28.33 
 
 
342 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  29.46 
 
 
342 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  30.99 
 
 
342 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  29.88 
 
 
335 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  30.94 
 
 
341 aa  124  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  30.47 
 
 
334 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  30.47 
 
 
334 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  31.91 
 
 
348 aa  123  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  31.09 
 
 
349 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  30.47 
 
 
334 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  31.02 
 
 
334 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  29.65 
 
 
348 aa  119  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  27.92 
 
 
344 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  33.14 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  28.87 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  33.42 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  30.29 
 
 
362 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  27.62 
 
 
327 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  28.12 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  27.33 
 
 
327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  29.59 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  28.81 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  30.79 
 
 
335 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  28.27 
 
 
324 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  28.27 
 
 
324 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22840  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  33.53 
 
 
324 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  27.38 
 
 
324 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  29.53 
 
 
331 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  32.85 
 
 
330 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0190  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  29.48 
 
 
731 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  31.74 
 
 
340 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  32.3 
 
 
340 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  32.37 
 
 
340 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  28.13 
 
 
336 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  28.57 
 
 
324 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  28.57 
 
 
324 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  28.13 
 
 
336 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  28.57 
 
 
324 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  27.06 
 
 
324 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  29.23 
 
 
352 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  29.3 
 
 
332 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  31.79 
 
 
340 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  29.3 
 
 
332 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  29.04 
 
 
337 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  31.79 
 
 
365 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  31.79 
 
 
365 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  28.66 
 
 
336 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  30.26 
 
 
337 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  30.26 
 
 
337 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  31.05 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0189  Asparaginase/glutaminase  30.5 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  30.26 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  30.92 
 
 
340 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  29.04 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  29.04 
 
 
337 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  29.37 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  30.26 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  29.04 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  27.33 
 
 
310 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  27.71 
 
 
325 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>