More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0740 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 		 382 aa  784    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  68.95 
 
 		 409 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  68.67 
 
 		 383 aa  536  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  65.44 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  65.95 
 
 		 411 aa  494  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  59.52 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  57.91 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  57.96 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  56.56 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  55.67 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  54.31 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  53.94 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.23 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  47.21 
 
 		 411 aa  337  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.51 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.97 
 
 		 418 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.23 
 
 		 418 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.97 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.86 
 
 		 419 aa  318  9e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.59 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.79 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.744807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  41.97 
 
 		 444 aa  285  8e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.01 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.09 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.32 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.54 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.44 
 
 		 417 aa  252  6e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.85 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  30.72 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  30.38 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  31.23 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  31.21 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  29.57 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  28.78 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  29.81 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  31.38 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  31.38 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  31.38 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  31.35 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  31.38 
 
 		 334 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  29.6 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  31.69 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  31.08 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  33.33 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  30.03 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  28.53 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  33.33 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1881  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00109074  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  31.08 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2723  cytoplasmic asparaginase I  33.45 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  hitchhiker  0.00370317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1388  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0184597  normal  0.373487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1421  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0271356  normal  0.712342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1405  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  normal  0.0252011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  32.99 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  32.99 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  31.88 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  33.02 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  32.99 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  31.41 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  30.92 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  34.15 
 
 		 339 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  28.57 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  30.31 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  34.03 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  30.72 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  31.1 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  30.58 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  31.49 
 
 		 348 aa  119  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  29.19 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  31.96 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  28.41 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  28.95 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  26.99 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  31.55 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2092  cytoplasmic asparaginase I  31.6 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1983  cytoplasmic asparaginase I  31.6 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  26.99 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  33.56 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2347  cytoplasmic asparaginase I  31.6 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109422  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  30.09 
 
 		 352 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  31.07 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1919  asparaginase  32.29 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1680  cytoplasmic asparaginase I  30.9 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  32.87 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  27.16 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2298  cytoplasmic asparaginase I  30.63 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000114011  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  32.53 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  31.23 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  32.07 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  30.36 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  29.17 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  32.07 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  31.93 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>