More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4329 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  92.76 
 
 
355 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  100 
 
 
355 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  98.87 
 
 
355 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  71.56 
 
 
352 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  53.85 
 
 
354 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  43.97 
 
 
327 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  45.66 
 
 
338 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  44.06 
 
 
334 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  41.37 
 
 
349 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  36.76 
 
 
327 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  36.14 
 
 
327 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  41.79 
 
 
340 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  37.61 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  38.54 
 
 
332 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  38.54 
 
 
332 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  42.07 
 
 
330 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  36.61 
 
 
344 aa  210  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  37.04 
 
 
348 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  41 
 
 
347 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  41.09 
 
 
340 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  41.69 
 
 
340 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  41.89 
 
 
396 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  41.09 
 
 
365 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  41.09 
 
 
365 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  41.89 
 
 
347 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  41.89 
 
 
347 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  41.89 
 
 
347 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  41.89 
 
 
347 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  41.89 
 
 
347 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  41.89 
 
 
347 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  39.56 
 
 
355 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  40.48 
 
 
340 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  36.11 
 
 
324 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  40.48 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  36.99 
 
 
348 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  39.02 
 
 
328 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  41.75 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  40.84 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  38.14 
 
 
331 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  37.01 
 
 
348 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  37.09 
 
 
323 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  36.94 
 
 
338 aa  192  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  35.59 
 
 
348 aa  192  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  33.77 
 
 
327 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  35.19 
 
 
324 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  35.49 
 
 
324 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  35.49 
 
 
324 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  35.8 
 
 
324 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  35.8 
 
 
324 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  35.8 
 
 
324 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  36.09 
 
 
352 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  36.09 
 
 
352 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  36.09 
 
 
356 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  36.09 
 
 
352 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  34.37 
 
 
320 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  34.49 
 
 
347 aa  186  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  34.89 
 
 
354 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  36.16 
 
 
320 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  40 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  37.46 
 
 
320 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  34.9 
 
 
338 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  34.35 
 
 
310 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  34.64 
 
 
321 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  34.69 
 
 
310 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  34.01 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1178  asparaginase/glutaminase  35.51 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228392  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  35.57 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  33.66 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  30.87 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  34.69 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  32.9 
 
 
322 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  33.33 
 
 
349 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  36.42 
 
 
348 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  35.33 
 
 
348 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  32.22 
 
 
322 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  32.22 
 
 
322 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  35.04 
 
 
348 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  35.33 
 
 
348 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  35.33 
 
 
348 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  36.78 
 
 
352 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  34.64 
 
 
348 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  31.65 
 
 
325 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  35.04 
 
 
348 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  37.01 
 
 
321 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  35.04 
 
 
348 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  35.04 
 
 
348 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  35.04 
 
 
348 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  35.04 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  33.76 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  37.72 
 
 
339 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  32.95 
 
 
347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  34.51 
 
 
346 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  34.51 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  36.56 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  35.67 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  30.59 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  34.4 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  34.76 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  34.76 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  34.76 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>