More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0731 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0731  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  100 
 
 
418 aa  840    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.452449  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1221  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  80.86 
 
 
417 aa  694    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0144  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  76.79 
 
 
417 aa  642    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0159  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  78.47 
 
 
417 aa  658    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1797  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  52.83 
 
 
447 aa  409  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0649571  normal  0.610323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0361  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  50.82 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1224  L-asparaginase, type I  44.72 
 
 
411 aa  322  8e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1720  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  44.9 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.744807 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1370  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.61 
 
 
419 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.108214  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0324  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.37 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1406  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.09 
 
 
418 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0450215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0513  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.09 
 
 
418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.970726  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0100  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.95 
 
 
429 aa  308  9e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00378073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1913  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  42.82 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1002  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  43.21 
 
 
410 aa  292  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0579  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.1 
 
 
426 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1026  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40 
 
 
415 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.64 
 
 
410 aa  278  9e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.731285  normal  0.499768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0740  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.99 
 
 
382 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.486321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0853  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  42.18 
 
 
409 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0173976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0584  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit D  42.09 
 
 
424 aa  272  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  39.29 
 
 
424 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.365888 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3003  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.81 
 
 
413 aa  270  5e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0272423  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1079  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.91 
 
 
383 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470158  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2140  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  41.18 
 
 
434 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116186  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2973  L-asparaginase, type I  40.23 
 
 
427 aa  260  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1652  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  40.47 
 
 
423 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0577  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  38.7 
 
 
411 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000010795  decreased coverage  0.000463482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3413  L-asparaginase, type I  32.37 
 
 
339 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1900  asparaginase  31.75 
 
 
329 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0851  L-asparaginase  31.99 
 
 
341 aa  159  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.23635  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3159  L-asparaginase  31.59 
 
 
334 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2121  L-asparaginase  32.17 
 
 
334 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2916  L-asparaginase  31.59 
 
 
334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2884  L-asparaginase  31.59 
 
 
334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3137  L-asparaginase  31.59 
 
 
334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3116  L-asparaginase  31.59 
 
 
334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3136  L-asparaginase  31.3 
 
 
334 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2846  L-asparaginase  31.3 
 
 
334 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2650  L-asparaginase, type I  29.34 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0247  L-asparaginase, type I  32.71 
 
 
347 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1807  asparaginase  28.27 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0241049  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02780  L-asparaginase I  28.53 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1580  cytoplasmic asparaginase I  31.62 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147786  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0263  L-asparaginase, type I  28.26 
 
 
342 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0392514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0303  L-asparaginase, type I  30.7 
 
 
340 aa  119  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0759  L-asparaginase, type I  33.33 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  30.84 
 
 
349 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4073  predicted protein  27.96 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2158  cytoplasmic asparaginase I  31.07 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2079  cytoplasmic asparaginase I  29.04 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1963  cytoplasmic asparaginase I  28.32 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.145247  normal  0.0808598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002912  L-asparaginase  30.15 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5475  L-asparaginase, type I  30.57 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.241616  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03045  cytoplasmic asparaginase I  29.56 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2584  cytoplasmic asparaginase I  27.99 
 
 
337 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2421  cytoplasmic asparaginase I  28.67 
 
 
337 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2932  hypothetical protein  28.36 
 
 
336 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2786  hypothetical protein  28.36 
 
 
336 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1908  cytoplasmic asparaginase I  28.32 
 
 
337 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  hitchhiker  0.0000134735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2070  cytoplasmic asparaginase I  28.32 
 
 
337 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0395614  hitchhiker  0.000282097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2037  asparaginase  34.07 
 
 
346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3394  cytoplasmic asparaginase I  29.67 
 
 
336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01648  cytoplasmic asparaginase I  29.92 
 
 
335 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00821331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1280  L-asparaginase, type I  27.91 
 
 
342 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.223178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1778  L-asparaginase, type I  31.88 
 
 
359 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285439  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  30.72 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  30.72 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1902  cytoplasmic asparaginase I  27.62 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104501  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1722  cytoplasmic asparaginase I  30.19 
 
 
337 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0150989  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1544  cytoplasmic asparaginase I  29.04 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01736  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 
338 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0416941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2295  cytoplasmic asparaginase I  28.68 
 
 
337 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000365461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1875  L-asparaginase, type I  28.22 
 
 
338 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000667162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01724  hypothetical protein  28.22 
 
 
338 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0790373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1940  cytoplasmic asparaginase I  28.41 
 
 
337 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.680808  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1865  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 
338 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  decreased coverage  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2022  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 
338 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000625238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2412  cytoplasmic asparaginase I  28.68 
 
 
337 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0031003  hitchhiker  0.000169421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1991  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 
338 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.310429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2488  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 
338 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.407243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2050  cytoplasmic asparaginase I  28.68 
 
 
337 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0327097  hitchhiker  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1969  cytoplasmic asparaginase I  29.92 
 
 
339 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0253632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1424  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 
338 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.202154  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2054  cytoplasmic asparaginase I  28.68 
 
 
337 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0013597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1851  cytoplasmic asparaginase I  28.22 
 
 
338 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0116887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2265  cytoplasmic asparaginase I  28.88 
 
 
360 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2121  L-asparaginase  28.79 
 
 
359 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  30.7 
 
 
324 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2146  cytoplasmic asparaginase I  28.2 
 
 
337 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00274242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  30.71 
 
 
327 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2052  cytoplasmic asparaginase I  29.17 
 
 
338 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0189  Asparaginase/glutaminase  28.45 
 
 
369 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1969  cytoplasmic asparaginase I  29.17 
 
 
339 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.316331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2254  cytoplasmic asparaginase I  27.27 
 
 
338 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000486388  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2211  cytoplasmic asparaginase I  30.08 
 
 
339 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0542  L-asparaginase, type I  27.19 
 
 
339 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3641  asparaginase/glutaminase  31.01 
 
 
300 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2233  L-asparaginase, type I  27.49 
 
 
379 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.30257 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05280  L-asparaginase type I family protein  29.08 
 
 
335 aa  103  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>