More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0883 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0883  asparaginase/glutaminase  100 
 
 
334 aa  676    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.551989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1215  asparaginase/glutaminase  69.44 
 
 
338 aa  478  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  45.68 
 
 
349 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1723  L-asparaginase  42.9 
 
 
327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.127314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2005  L-asparaginase  42.9 
 
 
327 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1378  L-asparaginase  45.34 
 
 
324 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000016195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1377  L-asparaginase  45.34 
 
 
324 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.29789  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4846  Asparaginase  43.34 
 
 
355 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184779  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1218  L-asparaginase  43.79 
 
 
324 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000485776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1418  asparaginase/glutaminase  44.1 
 
 
324 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000659978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4329  asparaginase  44.06 
 
 
355 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4698  Asparaginase  43.75 
 
 
355 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1622  L-asparaginase  45.03 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00318095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1406  L-asparaginase  45.03 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1516  L-asparaginase  45.03 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000137409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3068  Asparaginase  41.88 
 
 
327 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000788592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0779  L-asparaginase  39.82 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3140  asparaginase  40.99 
 
 
352 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1590  L-asparaginase  45.21 
 
 
310 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36341e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1551  L-asparaginase  44.22 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000310324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3794  L-asparaginase  43.89 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538157  hitchhiker  0.000000163476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1657  L-asparaginase  44.55 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000496167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1679  asparaginase family protein  38.7 
 
 
320 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0304633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1535  asparaginase/glutaminase  39.51 
 
 
322 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1566  asparaginase/glutaminase  39.51 
 
 
322 aa  236  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2187  asparaginase/glutaminase  39.32 
 
 
320 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560936  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1046  L-asparaginase  38.08 
 
 
322 aa  229  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1837  asparaginase/glutaminase  38.08 
 
 
321 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1960  L-asparaginase type II, putative  41.93 
 
 
332 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0782  asparaginase  40.37 
 
 
320 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1886  putative L-asparaginase type II  41.61 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0083675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1297  asparaginase/glutaminase  38.08 
 
 
320 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0029  Asparaginase/glutaminase  35.58 
 
 
328 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2849  asparaginase  39.62 
 
 
330 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0637952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1690  L-asparaginase  40.56 
 
 
307 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.758697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2181  Asparaginase/glutaminase  36.83 
 
 
327 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000581575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0890  asparaginase  37.1 
 
 
354 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2741  asparaginase  37.88 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  37.16 
 
 
344 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0447  Asparaginase/glutaminase  36.84 
 
 
323 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3001  asparaginase/glutaminase  36.99 
 
 
350 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0900  asparaginase/glutaminase  36.5 
 
 
327 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  38.07 
 
 
348 aa  186  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  37.39 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0860  Asparaginase/glutaminase  36.5 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.832508  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3220  asparaginase/glutaminase  38.26 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0827  Asparaginase/glutaminase  37.29 
 
 
327 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  36.78 
 
 
348 aa  179  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1946  asparaginase/glutaminase  35.8 
 
 
352 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0515464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0337  L-asparaginase  36.42 
 
 
322 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0094  asparaginase/glutaminase  34.95 
 
 
321 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.875352  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  36.47 
 
 
338 aa  177  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  33.33 
 
 
356 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  33.33 
 
 
352 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  33.33 
 
 
352 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  33.33 
 
 
352 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  34.71 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  34.12 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  35.54 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  35.24 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  34.93 
 
 
348 aa  170  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  34.94 
 
 
348 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  32.43 
 
 
365 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  32.43 
 
 
365 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  32.43 
 
 
340 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  31.93 
 
 
340 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  34.15 
 
 
323 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  32.02 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1194  asparaginase/glutaminase  31.19 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  32.23 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1888  asparaginase family protein  35.84 
 
 
329 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000189998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  34.95 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  34.94 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0192  Asparaginase/glutaminase  33.74 
 
 
328 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1009  L-asparaginase II  33.02 
 
 
325 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0200439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37190  L-asparaginase/GlutRNAGln amidotransferase subunit D  34.15 
 
 
328 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  34.29 
 
 
340 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  35.11 
 
 
338 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1962  asparaginase family protein  35.84 
 
 
329 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  34.6 
 
 
348 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  35.44 
 
 
346 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  33.64 
 
 
352 aa  159  8e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1160  asparaginase/glutaminase  30.79 
 
 
329 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511952  normal  0.0114275 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1709  anthranilate synthase component II  31.38 
 
 
325 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  33.93 
 
 
346 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0683  L-asparaginases, type II  36.2 
 
 
316 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  33.93 
 
 
346 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  33.87 
 
 
345 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  33.54 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  33.98 
 
 
375 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  33.87 
 
 
345 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  31.53 
 
 
347 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  31.53 
 
 
396 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  31.53 
 
 
347 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  33.87 
 
 
345 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2021  Asparaginase/glutaminase  34.45 
 
 
362 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  31.53 
 
 
347 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  31.53 
 
 
347 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  31.53 
 
 
347 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  31.53 
 
 
347 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>