38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0386 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0386  general secretion pathway protein I  100 
 
 
122 aa  243  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  30.83 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  30.36 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  30.56 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  30.56 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  30.56 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  31.48 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  31.48 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  31.48 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  30.56 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  32.29 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  29.63 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  37.37 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  37.76 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  31.52 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  29.2 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  28.32 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  25.83 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  25.66 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  28.07 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  26.79 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  29.79 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  28.3 
 
 
125 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  32.26 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  31.15 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  30.1 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  31.53 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  31.07 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  38.1 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  29 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  35.64 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  33.04 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  45.76 
 
 
119 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  24.79 
 
 
125 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  27.43 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>