More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3556 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1266  GTP-binding protein LepA  57 
 
 		 600 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00508967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1431  GTP-binding protein LepA  53.02 
 
 		 599 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1241  GTP-binding protein LepA  54.97 
 
 		 595 aa  700    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1893  GTP-binding protein LepA  53.61 
 
 		 601 aa  661    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1152  GTP-binding protein LepA  58.75 
 
 		 607 aa  733    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  54.92 
 
 		 601 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1060  GTP-binding protein LepA  54.29 
 
 		 598 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.568837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  57.98 
 
 		 607 aa  731    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1174  GTP-binding protein LepA  54.04 
 
 		 598 aa  680    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  59.43 
 
 		 610 aa  741    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1039  GTP-binding protein LepA  54.22 
 
 		 602 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1346  GTP-binding protein LepA  52.36 
 
 		 596 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4220  GTP-binding protein LepA  52.7 
 
 		 595 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  57.98 
 
 		 607 aa  731    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  57.98 
 
 		 607 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  57.98 
 
 		 607 aa  731    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0541  GTP-binding protein LepA  54.55 
 
 		 597 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1837  GTP-binding protein LepA  54.88 
 
 		 610 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1834  GTP-binding protein LepA  54.88 
 
 		 610 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0330  GTP-binding protein LepA  53.26 
 
 		 598 aa  661    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2026  GTP-binding protein LepA  55.39 
 
 		 596 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.788972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  76.62 
 
 		 614 aa  966    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  56.81 
 
 		 603 aa  695    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2255  GTP-binding protein LepA  53.7 
 
 		 597 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2089  GTP-binding protein LepA  55.26 
 
 		 599 aa  670    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  53.08 
 
 		 603 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  57.38 
 
 		 603 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2897  GTP-binding protein LepA  54.55 
 
 		 597 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2461  GTP-binding protein LepA  55.17 
 
 		 606 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2088  GTP-binding protein LepA  54.04 
 
 		 599 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1618  GTP-binding protein LepA  54.39 
 
 		 599 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000183904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4244  GTP-binding protein LepA  54.04 
 
 		 597 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  55.7 
 
 		 605 aa  677    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1582  GTP-binding protein LepA  57.14 
 
 		 602 aa  685    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0490  GTP-binding protein LepA  55.43 
 
 		 605 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  58.36 
 
 		 606 aa  706    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  55.02 
 
 		 629 aa  711    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2817  GTP-binding protein LepA  56.47 
 
 		 601 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  57.82 
 
 		 607 aa  731    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1637  GTP-binding protein LepA  53.19 
 
 		 596 aa  664    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  55.97 
 
 		 602 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  58.36 
 
 		 604 aa  706    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1751  GTP-binding protein LepA  54.97 
 
 		 597 aa  691    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.951642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  60.34 
 
 		 602 aa  741    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1728  GTP-binding protein LepA  54.21 
 
 		 597 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  55.46 
 
 		 601 aa  681    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1262  GTP-binding protein LepA  79.66 
 
 		 682 aa  986    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2587  GTP-binding protein LepA  54.08 
 
 		 605 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3431  GTP-binding protein LepA  52.27 
 
 		 599 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1740  GTP-binding protein LepA  54.65 
 
 		 603 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0723803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2246  GTP-binding protein LepA  52.67 
 
 		 599 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0860  GTP-binding protein LepA  54.88 
 
 		 597 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0198649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1004  GTP-binding protein LepA  54.88 
 
 		 597 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0141271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3638  GTP-binding protein LepA  55.24 
 
 		 603 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1083  GTP-binding protein LepA  54.55 
 
 		 597 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.632342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2768  GTP-binding protein LepA  53.37 
 
 		 596 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000363833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1629  GTP-binding protein LepA  51.74 
 
 		 606 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.622168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0438  GTP-binding protein LepA  53.24 
 
 		 610 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.587658  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0364  GTP-binding protein LepA  53.42 
 
 		 598 aa  661    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2421  GTP-binding protein LepA  53.87 
 
 		 597 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.417593  normal  0.344469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0244  GTP-binding protein LepA  54.24 
 
 		 601 aa  673    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0678  GTP-binding protein LepA  53.26 
 
 		 599 aa  672    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0652  GTP-binding protein LepA  54.88 
 
 		 597 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3493  GTP-binding protein LepA  100 
 
 		 639 aa  1298    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1516  GTP-binding protein LepA  59.93 
 
 		 600 aa  691    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3151  GTP-binding protein LepA  52.79 
 
 		 598 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000523336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4075  GTP-binding protein LepA  53.85 
 
 		 605 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  52.94 
 
 		 596 aa  681    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2295  GTP-binding protein LepA  59.43 
 
 		 600 aa  713    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2010  GTP-binding protein LepA  59.26 
 
 		 600 aa  713    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1242  GTP-binding protein LepA  53.64 
 
 		 598 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2425  GTP-binding protein LepA  57.48 
 
 		 601 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2850  GTP-binding protein LepA  52.53 
 
 		 596 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2932  GTP-binding protein LepA  52.53 
 
 		 596 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000771458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1344  GTP-binding protein LepA  52.86 
 
 		 627 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.269651  normal  0.813727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2931  GTP-binding protein LepA  53.37 
 
 		 596 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0135754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1583  GTP-binding protein LepA  57.41 
 
 		 599 aa  711    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0013667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  53.6 
 
 		 608 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1008  GTP-binding protein LepA  54.88 
 
 		 597 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54370  GTP-binding protein LepA  51.51 
 
 		 599 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  58.59 
 
 		 607 aa  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0581  GTP-binding protein LepA  56.44 
 
 		 623 aa  687    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0824  GTP-binding protein LepA  56.57 
 
 		 612 aa  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  57.74 
 
 		 620 aa  711    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  58.75 
 
 		 610 aa  729    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2240  GTP-binding protein LepA  75.17 
 
 		 617 aa  941    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1132  GTP-binding protein LepA  54.88 
 
 		 597 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0905  GTP-binding protein LepA  55.89 
 
 		 598 aa  691    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.446358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3028  GTP-binding protein LepA  52.69 
 
 		 596 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000110121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  80.67 
 
 		 606 aa  993    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1473  GTP-binding protein LepA  53.87 
 
 		 596 aa  675    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2331  GTP-binding protein LepA  56.3 
 
 		 598 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1859  GTP-binding protein LepA  56.43 
 
 		 605 aa  690    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.365032  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4417  GTP-binding protein LepA  53.79 
 
 		 614 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1891  GTP-binding protein LepA  73.03 
 
 		 635 aa  944    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.647784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3556  GTP-binding protein LepA  100 
 
 		 639 aa  1298    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0638  GTP-binding protein LepA  53.64 
 
 		 598 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3881  GTP-binding protein LepA  92.49 
 
 		 652 aa  1197    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2261  GTP-binding protein LepA  57.5 
 
 		 607 aa  712    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1193  GTP-binding protein LepA  55.83 
 
 		 602 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.417452  decreased coverage  0.00711169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>