More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl091 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl091  transcription antitermination factor  100 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0114  transcription antitermination protein NusG  61.21 
 
 
214 aa  268  5e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  37.17 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  40.21 
 
 
181 aa  128  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  34.33 
 
 
242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  34.33 
 
 
242 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  39.15 
 
 
182 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  39.15 
 
 
182 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  37.69 
 
 
203 aa  122  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  33.97 
 
 
267 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  38.1 
 
 
182 aa  121  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  36.65 
 
 
177 aa  121  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  34.38 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  35.42 
 
 
172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  37.17 
 
 
175 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  35.53 
 
 
183 aa  119  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  34.8 
 
 
306 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  34.85 
 
 
228 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  34.87 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  32.68 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  36.13 
 
 
178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  37.56 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  35.18 
 
 
266 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  32.84 
 
 
194 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  35 
 
 
277 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  35.89 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  32.37 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  32.99 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  35.57 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  36.36 
 
 
179 aa  111  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  32.66 
 
 
250 aa  111  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  32.99 
 
 
180 aa  111  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  34.85 
 
 
185 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  36.96 
 
 
179 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  34.03 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  35.18 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  35.45 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  31.84 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
280 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  30.29 
 
 
272 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  35.57 
 
 
173 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  35.57 
 
 
173 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  36.7 
 
 
177 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
262 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  34.36 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  33.51 
 
 
175 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  33.51 
 
 
188 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  34.65 
 
 
317 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  30.39 
 
 
301 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  35.6 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  35.79 
 
 
175 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
265 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  31.91 
 
 
187 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  33.66 
 
 
273 aa  105  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  35.38 
 
 
185 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  34.55 
 
 
201 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  30.48 
 
 
266 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf093  transcription antitermination protein NusG  34.69 
 
 
197 aa  105  6e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00871231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  32.46 
 
 
173 aa  104  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  33.68 
 
 
175 aa  104  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  34.92 
 
 
178 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  32.85 
 
 
275 aa  104  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  33.86 
 
 
246 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  38.1 
 
 
176 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  33.86 
 
 
243 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  35.38 
 
 
194 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  30.62 
 
 
271 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  30.62 
 
 
270 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  35.38 
 
 
194 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  30.62 
 
 
270 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  32.8 
 
 
320 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  32.02 
 
 
299 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  36.51 
 
 
178 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0438  transcription termination/antitermination factor NusG  34.04 
 
 
204 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  33.33 
 
 
175 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  32.52 
 
 
267 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  34.2 
 
 
181 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  33.86 
 
 
197 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  35.11 
 
 
177 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  33.17 
 
 
193 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  33.17 
 
 
193 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  35.11 
 
 
177 aa  101  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  32.2 
 
 
287 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  32.64 
 
 
181 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  32.64 
 
 
181 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  35.11 
 
 
177 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  35.45 
 
 
177 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  32.64 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  32.64 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  33.67 
 
 
172 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  32.64 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>